Pe parcursul lunilor anterioare fusese aprins focul unei treziri spirituale în campusul studențesc. Pe măsură ce trezirea a crescut și a atras în ea tot mai mulți studenți zeloși, au apărut tensiuni între ei și cadrele sceptice ale facultății, astfel că în consiliul director s-a luat decizia de a le interzice studenților chiar să insinueze că vreunul dintre profesori ar fi fost „ipocrit, carnal sau neconvertit”.
Nu a trecut mult timp și cineva a raportat că Brainerd ar fi făcut unele comentarii nepotrivite de acest fel și, deși el era cel mai bun student din clasa lui, Brainerd a fost exmatriculat. La această tragedie s-a adăugat faptul că, pentru a putea sluji oficial în Connecticut, era nevoie să fi absolvit studiile la Yale, Harvard sau la o universitate din Europa. Visurile și dorințele lui Brainerd de a ajunge păstor au fost spulberate. Acesta a fost un moment foarte dificil din viața lui, așa cum explică John Piper, astfel că Brained s-a simțit rupt de chemarea vieții sale.
Acest eveniment a fost tragic, având în vedere că David Brainerd avea să moară destul de repede, la vârsta de 29 de ani. Numai că avem aici o scurtă biografie a vieții lui, o poveste de viață care merită să fie spusă în repetate rânduri. O mărturie de viață care nu are de-a face cu exmatricularea, ci cu ceea ce Dumnezeu a făcut prin el în acei câțiva ani dintre exmatricularea și moartea sa.