Machine Learning dalam Bioinformatika
এই ইবুকখনৰ বিষয়ে
Hepatoma merupakan suatu penyakit kanker hati, yang salah satu penyebabnya adalah infeksi virus hepatitis B. Terjadinya penyakit ini relatif lama dalam perkembangannya dari kronis, sirosis dan fibrosis hingga terjadi hepatoma, namun sering terjadi keterlambatan dalam penanganannya. Hal ini disebabkan kurangnya gejala-gejala klinis yang muncul (silent symptoms) hingga mendorong banyaknya penelitian ke arah biologi molekuler dengan menggunakan materi genetika dari pasien untuk membangun aplikasi dengan metode machine learning. Metode ini menggunakan pendekatan komputasi berbasis data dalam membuat rule sehingga mampu mengenali suatu penyakit. Buku ini dapat digunakan sebagai referensi untuk mengembangkan suatu aplikasi diagnosis atau prognosis suatu penyakit dengan menggunakan metode machine learning.
Adapun kandungan dari buku ini, dimulai dari latar belakang pentingnya pendekatan machine learning dalam bioinformatika, termasuk konsep dasar dan cakupan machine learning dan bioinformatika. Selanjutnya pembahasan terkait profiling salah satu penyakit, yakni hepatoma menggunakan data sekuen DNA maupun ekspresi gen host. Peranan metode machine learning untuk profiling dikupas secara detail mulai preprocessing, meliputi clustering, seleksi fitur dan reduksi fitur, kemudian penjajaran sekuen DNA hingga deteksi atau prediksi hepatoma. Penjabaran langkah-angkah di setlap metode hingga hasil evaluasi tingkat performansi yang dicapai. Harapan dari penulis, pembaca diharapkan bisa mengerti terkait peranan machine leaming dalam bioinformatika sehingga dapat digunakan sebagai acuan dalam penyelesalan permasalahan kasus nyata dalam bidang biologi khususnya dan dalam bidang kesehatan pada umumnya.
মূল্যাংকন আৰু পৰ্যালোচনাসমূহ
লিখকৰ বিষয়ে
Dr. Lailil Muflikhah, S.Kom., M.Sc. lahir di Lamongan, 13 November 1974 bergabung dengan Universitas Brawijaya sejak tahun 2005 hingga sekarang. S1 Teknik Informatika, ITS Surabaya lulus pada tahun 1998.. Kemudian melanjutkan studinya S2 jurusan Computer Information System di Universitas Teknologi Petronas. Pada tahun 2014-2017 menjadi Kepala Laboratorium Komputasi Cerdas dan Visualisai FILKOM UB. Selanjutnya, telah selesai mengambil pendidikan program doctoral jurusan biologi FMIPA UB dengan disertasi terkait bioinformatika untuk deteksi hepatoma. Spesifikasi riset yang sering dilakukan berkaitan dengan Artificial Intelligent dan Data Mining dalam bidang kesehatan menggunakan metode-metode Machine Learning.
Prof. Widodo, S.Si., M.Si., Ph.D.Med.Sc. lahir di Bojonegoro, 11 Agustus 1973. Bergabung untuk mengajar di jurusan Biologi, FMIPA, Universitas Brawijaya sejak 2003 hingga sekarang. Menjadi JICA Fellow di AIST Tsukuba, Jepang pada tahun 2003. Telah menyelesaikan studi program doctoral di University of Tsukuba tahun 2004-2008. Pada tahun 2011-2015 menjadi Ketua Jurusan Biologi, Koordinator penelitian di LPPM pada tahun 2016-2017. Kemudian telah melakukan Visiting Assoc. Professor di UTM Malaysia pada tahun 2016. Dilanjutkan ke Ritsumeikan University, Japan dalam rangka visiting Professor pada tahun 2017-2019. Pada tahun 2019 menjadi Kepala Laboratorium Pusat Ilmu Hayati. Selanjutnya pada tahun 2020 hingga sekarang dipercaya menjadi Dekan FMIPA, Universitas Brawijaya. Spesialisasi riset di bidang biologi molekuler, biologi kanker, dan bioinformatika berbasis Artificial Intelligent.
Wayan Firdaus Mahmudy, S.Si., M.T., Ph.D. lahir di Gresik, 19, September 1972. Bergabung dengan Universitas Brawijaya sejak 1997 hingga sekarang. Lulus sarjana di bidang statistika, MIPA, UB. Kemudian melanjutkan program magister di Teknik Informatika, ITS. Selanjutnya melanjutkan program doctoral di University of South Australia. Kini menjadi reviewer di berbagai jurnal nasional dan internasional sejak 2013 hingga sekarang. Pada tahun 2013-2004 menjadi tenaga ahli pengembangan sistem “The StressCafé Project” kerjasama Centre for Applied Psychological Research, University of South Australia dan Pemerintah Australia Pada tahun 2014-2016 menjadi ketua Bidang Penelitian pada LPPM UB dan menjadi Dekan Fakultas Ilmu Komputer sejak 2016 hingga sekarang. Berbagai penelitiannya di bidang Artificial Intelligence, Algoritma Evolusi dan Data Mining.
Dr. Ir. Solimun, M.S. lahir tanggal 15 Desember 1961 di Malang, sejak 1987 hingga kini bekerja sebagai Dosen Universitas Brawijaya. Gejar Sarjana Pertanian diperoleh dari Fakultas Pertanian Universitas Brawijaya (1986), Magister Sains di bidang Statistika dari Institut Pertanian Bogor (1993), dan Doktor Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam dari Universitas Airlangga Surabaya (1997). Buku yang pernah ditulis adalah Analisis Multivariat (1), Pemodelan Persamaan Struktural/SEM (4), Analisis Reliabilitas dan Survival (1), dan Metodologi Penelitian Kuantitatif (1). Pengalaman menjadi instruktur pelatihan dan workshop Analisis Multivariat (SEM), dan Metodologi Penelitian di berbagai perguruan tinggi, lembaga penelitian, institusi, dan perusahaan, dilakukan sejak tahun 2001 sampai dengan sekarang.
