Arie Saptaji menulis puisi sejak awal 1980-an, pernah dimuat antara lain di Nova, Hai, Anita Cemerlang, Kedaulatan Rakyat, Bernas, Suara Pembaruan, dan Sitinggil, selain ditayangkan di blog dan akun media sosial pribadi. Puisinya, “Keluarga Kecilku”, diterjemahkan ke dalam bahasa Inggris dan dimuat dalam antologi dwibahasa Meretas Karya Anak Bangsa (2012). Beberapa puisi lain terhimpun dalam antologi bersama Ini Aku (1991), Gang Guru (2014), dan Sebuah Usaha Memeluk Kedamaian (2021).
Ia telah menulis 30 buku, termasuk dua kumpulan cerpen Never Be Alone (2005) dan Lintasan Cinta (2007) serta Trilogi Temanggung yang terdiri atas Warrior (2005/2020), Dalam Rinai Hujan (2012/2020), dan Temanggung, Yogyakarta (2020). Novel terbarunya, Gendis: Ketika Kembang Tembakau Bermekaran (2021), diterbitkan oleh platform digital kumparan+.