Scooby-Doo! og Krypto!

Da Justice League forsvinder, og skurkene overtager Metropolis, er der kun ét hold, der kan løse mysteriet: Scooby-Doo og banden! Men vent, der er en ny hund i byen – Krypto – Supermans superhund med superkræfter. Mystery Inc. får brug for al den hjælp, de kan få, da fantomerne indtager Justice Leagues hovedkvarter. Og har Lex Luthor endelig vendt forbryderlivet ryggen? Eller samarbejder han i virkeligheden med The Joker og Harley Quinn? Det kan godt være, at DC's superskurke har kæmpet mod Superman før, men denne gang står de over for en helt ny modstander: En flok nysgerrige unger!