Tujuan utama sistem GFS adalah memberikan suatu kerangka kerja konseptual dan kerangka akuntansi yang komprehensif sehingga dapat digunakan untuk menganalisis dan mengevaluasi kebijakan fiskal suatu negara baik disektor pemerintah maupun di sektor publik yang lebih luas. Lebih lanjut dinyatakan bahwa sistem GFS dirancang untuk menyediakan data statistik yang memungkinkan para pengambil keputusan dan para analisis untuk mempelajari perkembangan/progress dalam operasi keuangan, posisi keuangan, dan kondisi likuiditas dari sektor pemerintah dan sektor publik secara konsisten dan sistematik. Data yang dihasilkan dari sistem GFS yang lengkap dapat digunakan untuk menguji/ menginvestigasi area khusus dari kegiatan operasi pemerintah. Harmonisasi antara sistem GFS dengan sistem statistik ekonomi makro lainnya menunjukkan bahwa data dari sistem GFS dapat dikombinasikan dengan data dari sistem lain untuk mengukur perkembangan sektor pemerintah atau sektor publik dalam hubungannya dengan sektor ekonomi lainnya.